2001年6月21日至25日，中国科学技术协会第六次全国代表大会在北京隆重召开。出席本次大会的代表共947名，特邀代表128名。由于香港、澳门相继回归祖国，大会设立了港澳台及海外科技工作者特邀代表团。来自美国、英国、德国、日本等国的具有中国国籍的科技工作者，第一次参加中国科协的代表大会。党和国家领导人江泽民、李鹏、朱镕基、李瑞环、胡锦涛、尉健行、李岚清出席开幕式。出席开幕式的还有丁关根、张万年、罗干、温家宝、曾庆红、邹家华、彭珮云、钱正英、朱光亚等领导同志，中央和国家机关各部委负责同志和各省、自治区、直辖市党政有关领导同志。大会的中心任务是：高举邓小平理论伟大旗帜，团结和动员广大科技工作者，努力实践“三个代表”的重要思想，积极投身科教兴国事业，为完成“十五”计划，加快推进改革开放和社会主义现代化建设而努力奋斗。大会的主要议程是：听取和审议中国科协第五届全国委员会的工作报告；修改《中国科学技术协会章程》；选举中国科协新一届领导机构。
　　江泽民总书记做重要讲话。周光召受五届全委会的委托，作题为《在新世纪创造科教兴国新业绩，为实现“十五”计划和中华民族伟大复兴作出新的贡献》的工作报告。大会以无记名投票方式选举产生300名中国科协第六届全国委员会委员。审议通过了关于章程修改的决议。
　　闭幕式上通过了关于中国科协第五届全国委员会工作报告的决议。大会向294名全国优秀科技工作者荣誉称号获得者、100名中国青年科技奖获奖者以及360名中国科协先进工作者颁奖。周光召致闭幕词。
　　6月24日，召开六届一次全委会议，周光召再次当选为全委会主席，同时选举了16位副主席和45位常务委员。六届一次全委会议通过了授予中国科协荣誉委员职务的决定。
　　中国科协第六届主席、副主席、常务委员、荣誉委员、书记处书记是：
　　主　　　席：周光召
　　副　主　席：（16名，按姓氏笔划为序）
　　　　　　王　选　　韦　钰　　左铁镛　　白春礼　　旭日干
　　　　　　杨福家　　张玉台　　张启发　　陆延昌　　赵忠贤
　　　　　　胡启恒(女)　　　　　钱　易(女)　　　　　徐善衍
　　　　　　栾恩杰　　韩启德　　曾庆存
　　常务委员：（45名，名单略）
　　第一书记：张玉台
　　书　　记：徐善衍　　宋南平　　冯长根　　程东红(女)
　　荣誉委员：干福熹　　王连铮　　石元春　　叶叔华(女)
　　　　　　　母国光　　朱高峰　　庄逢甘　　孙大涌
　　　　　　　李振声　　杨　乐　　闵桂荣　　张存浩
　　　　　　　陈可冀　　陈　佳　　施典邦　　聂　力(女)
　　　　　　　顾方舟　　高　潮　　龚育之